Obowiązujące obecnie przepisy ustawy o VAT umożliwiają odzyskanie nadwyżki VAT nawet w przypadku rozpoczęcia przez urząd skarbowy postępowania wyjaśniającego. Zwrot nadwyżki w podstawowym 60-dniowym terminie jest możliwy, pod warunkiem że przedsiębiorca złoży w urzędzie skarbowym – wraz z podaniem o zwrot nadwyżki – zabezpieczenie majątkowe.
Jeśli wniosek wraz z zabezpieczeniem podatnik złoży na 13 dni przed upływem 60-dniowego terminu na zwrot lub później, wówczas urząd dokona zwrotu w terminie 14 dni od dnia złożenia zabezpieczenia. Jeśli złoży wniosek wraz z zabezpieczeniem wcześniej, to urząd dokona zwrotu nadwyżki VAT w terminie podstawowym.
