Pruski jest od września 2009 r. prezesem Bankowego Funduszu Gwarancyjnego, a także doradcą społecznym Prezydenta RP (od października 2010 r.). W latach 1998 – 2004 był członkiem Rady Polityki Pieniężnej. Był też pierwszym zastępcą prezesa NBP (2004 – 2008).